函证应付账款的的实质性程序：
向债权人发送询证函。注册会计师应根据审计准则的规定对询证函保持控制，包括确定需要确认或填列的信息、选择适当的被询证者、设计询证函，包括正确填列被询证者的姓名和地址，以及被询证者直接向注册会计师回函的地址等信息，必要时再次向被询证者寄发询证函等。
将询证函余额与已记录金额相比较，如存在差异，检查支持性文件。评价已记录金额是否适当。
对于未作回复的函证实施替代程序：如检查至付款文件(如，现金支出、电汇凭证和支票复印件)、相关的采购文件(如，采购订单、验收单、发票和合同)或其他适当文件。
如果认为回函不可靠，评价对评估的重大错报风险以及其他审计程序的性质、时间安排和范围的影响。
实质性程序的性质是指实质性程序的类型及其组合。例如，存货监盘就是由询问、观察、实物检查组合而成的程序。
实质性程序的具体类型包括：
细节测试(针对单一业务的检查、询问、观察、函证、重新计算);
实质性分析程序(批处理程序，适用于在一段时期内存在可预期关系的大量交易);
将财务报表与其所依据的会计记录进行核对或调节;
检查财务报表编制过程中作出的重大分录和其他调整。
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